Thiết kế tổ chức là chọn cách kết hợp giữa cơ cấu tổ chức và hệ thống kiểm soát để công ty có thể theo đuổi chiến lược của mình một cách hữu hiệu - tạo ra giá trị và lợi thế cạnh tranh bền vững. Cơ cấu tổ chức xác định các quan hệ báo cáo, các thủ tục, những hướng dẫn, hệ thống quyền lực và các quá trình ra quyết định.
Chiến lược chỉ có thể thực thi thông qua cơ cấu tổ chức, vì vậy sau khi xây dựng chiến lược cho công ty các nhà quản trị phải thực hiện ngay bước tiếp theo đó là thiết kế cơ cấu tổ chức. Cơ cấu tổ chức là phương tiện để các nhà quản trị có thể phối hợp các hoạt động giữa những chức năng hay các bộ phận khác nhau nhằm khai thác đầy đủ các kỹ năng và năng lực của họ.
Thiết kế tổ chức cũng tác động lên lợi nhuận của công ty. Nếu các nhà quản trị lựa chọn cơ cấu tổ chức đúng đắn thì sẽ tiết kiệm được chi phí dẫn đến lợi thế chi phí thấp, tăng khả năng tạo giá trị của một công ty dẫn đến các lợi thế khác biệt hoá và khả năng tính giá đặc biệt. Đó là nguyên nhân vì sao việc thực thi chiến lược là một vấn đề quan trọng trong môi trường cạnh tranh ngày nay, các công ty tái cơ cấu hay cải tổ cơ cấu của họ để cải thiện căn bản hiệu năng thông qua mô hình tổ chức tốt.
