1. Các logic block
Cấu trúc và nội dung của logic block được gọi là kiến trúc của nó. Kiến trúc của logic block có thể được thiết kế theo nhiều cách khác nhau. Một số logic block có thể chỉ đơn giản là các cổng AND hai ngõ nhập. Các logic block khác có cấu trúc phức tạp hơn như các multiplexer hay các bảng dò tìm (look-up table). Trong một số loại FPGA, các logic block có thể có cấu trúc hoàn toàn giống PAL. Hầu hết các logic block chứa một số loại flip-flop để hỗ trợ cho việc thực hiện các mạch tuần tự.
2. Khối I/O (IOB)
Mỗi chân I/O của linh kiện XC4000 có một IOB lập trình được với các buffer tương thích với các mức tín hiệu của TTL và CMOS. Nó được sử dụng như một lối ra, lối vào hoặc port 2 chiều. Một IOB được định cấu hình như một lối vào có thể có lối vào trực tiếp, chốt. Với việc định cấu hình một lối ra, IOB có lối ra trực tiếp. Lối ra bộ đệm của IOB có bộ điều khiển skew và slew. Các thanh ghi có giá trị đối với đường dẫn lối vào lối ra của một IOB được truyền các xung đảo riêng biệt. Có một set và reset toàn cục.
3. Các nguồn kết nối
Cấu trúc và nội dung của các nguồn kết nối trong FPGA được gọi là kiến trúc routing (routing architecture). Kiến trúc routing gồm các đoạn dây nối và các chuyển mạch lập trình được. Các chuyển mạch lập trình được có thể có nhiều cấu tạo khác nhau như: pass-transistor được điều khiển bởi cell RAM, các cầu chì nghịch (anti-fuse), EPROM transistor và EEPROM transistor. Giống như logic block, có nhiều cách khác nhau để thiết kế các kiến trúc routing. Một số FPGA cung cấp nhiều kết nối đơn giản giữa các logic block, một số khác cung cấp ít kết nối hơn nên routing phức tạp hơn.
