<p>
Khóa luận được thực hiện tại bộ môn Công Nghệ Sinh Học, trường đại học
Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh, trong khoảng thời gian từ tháng 3/2006 đến 8/2006.
Trong những năm qua sinh học không ngừng phát triển, đã tạo ra những kho dữ
liệu rất lớn về trình tự gene, protein,. của thực vật, động vật, Và với các thành tựu
vốn có của công nghệ thông tin, những trình tự gene này đã và đang được lưu trữ trong
cơ sở dữ liệu sinh học lớn như NCBI, EMBL, DDBj, Vì các cơ sở dữ liệu này quá
lớn và chứa rất nhiều thông tin khác nhau, không tập trung thành từng gene cụ thể nên
khó có thể thực hiện việc truy xuất các thông tin phục vụ trực tiếp cho một nghiên cứu
chuyên biệt, trong đó có phương pháp microsatellite. Do vậy, mục tiêu của chúng tôi
là tiến hành xây dựng cơ sở dữ liệu SSRs từ ESTs của cây dứa Ananas comosus được
lấy ở cơ sở dữ liệu sinh học NCBI.
Để đạt được mục tiêu trên, khóa luận cần đảm bảo thực hiện nội dung như sau:
Dùng Perl script để thu nhận trình tự các nucleotide của gene từ trang cơ
sở dữ liệu GenBank NCBI.
Tìm và tách các đoạn microsatellite có thể có trong mỗi đoạn gen.
Tìm hiểu về mô hình dữ liệu quan hệ, sử dụng mô hình này vào việc lưu
trữ dữ liệu các trình tự nucleotide và trình tự SSRs của Ananas comosus, và tạo
cơ sở dữ liệu chứa những trình tự này. Sau đó chuyển các dữ liệu này vào cơ sở
dữ liệu chính.
</p>
